Наукова робота кафедри мікробології,вірусології та імунології передбачає планування та виконання дисертаційних робіт, виконання кафедральних і міжкафедральних науково-дослідних робіт, організацію та участь у проведенні всеукраїнських і міжнародних наукових форумів, підготовку студентських наукових робіт. 

Всього за роки існування кафедри підготовлено 4 доктора наук, 30 кандидатів наук. Співробітниками кафедри опубліковано понад 600 статей, наукових тез, одержано 5 авторських свідоцтв на винаходи, одинадцять патентів.

Колектив кафедри брав участь у 9 міжнародних та близько 105 Всеукраїнських науково-практичних конференціях, конгресах, симпозіумах, присвячених актуальним питанням мікробіології, вірусології, імунології та паразитології.

Сфера наукових iнтересiв колективу кафедри: вивчення проблеми функцiонування мiкробiоценозiв людини в нормi та при патології; розробка способів корекції дисбактеріозів; мікробіологічні аспекти лікування синдрому стопи діабетика; дослідження проблеми стафілококових інфекцій, антибіотикорезистентності та бактеріального антагонізму; 

вивчення носійства стафілококів і  патогенних представникив родини Enterobacteriaceae. 

Основнi науковi здобутки кафедри: дослiджено мiкробiологiчнi аспекти променевої хвороби i бактерiоносiйства;

грунтовно вивчено лейкотоксини аеробних i анаеробних мiкроорганiзмiв, розроблено експрес-метод лабораторної дiагностики газової гангрени i спосiб виготовлення протигангренозних сироваток; всебiчно дослiджено імунологічні реакцiї при одночасному застосуваннi протикорової та протипаротитної вакцини, а також при рiзних схемах черевнотифозної iмунiзацiї; дослiджено мiкробiологiчнi та iмунологiчнi аспекти при електрохiрургiчних операцiях на органах травної системи; встановлено потенцiюючий або iнгiбуючий вплив жовчi та жовчних кислот на антимiкробну активнiсть антибiотикiв i нiтрофуранових препаратiв; впроваджено у практику метод визначення антибiотикочутливостi бактерiй;  створено капсулу для забору матерiалу iз шлунково-кишкового тракту; розроблено спосiб визначення iнфiкування жовчовивiдних шляхiв; дослiджено вплив електрогiдравлiчного ефекту на дрiжджi для одержання кормового бiлка; грунтовно вивчено рiзноманiтнi аспекти мiкробної екологiї шкiри людини в рiзнi вiковi перiоди в нормi та при патологiї, запропоновано препарати-пробiотики для корекцiї дисбiотичних зрушень; розроблена клiнiко-лабораторна дiагностика гострих шлунково-кишкових захворювань;досліджена мікрофлора опікової рани та розроблений метод її корекції пробіотиком А-бактерином. 

Кафедра ініціювала і була організатором  Всеукраїнської науково-практичної конференції «Актуальні проблеми екології мікроорганізмів»  проведеної 7-8 вересня 2007 року на базі конгрес-центру " Червона калина". Конференція була приурочена до 80 річчя від дня народження професора кафедри, доктора медичних наук Олександра Івановича Ситника.Учасники конференції зосередили свою увагу на вирішенні актуальні проблеми син - та аутекології мікроорганізмів.

Щорічно, починаючи з 1998 року  кафедра приймає участь в організації і проведенні науково-практичної  конференції «Довкілля і здоровۥя». Популярність конференціі серед науковців України неухильно зростає. Результати мікробіологічних досліджень публікуються у збірнику формуючи розділ: "Біологічні та мікробіологічні аспекти забезпечення здоров’я людини та збереження довкілля" . 

1-31 березня 2017 року асистент Н.Я. Кравець проходила стажування за програмою академічних обмінів для молодих працівників/вчених на базі кафедри мікробіології Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu. Завдяки співпраці між Тернопільським державним медичним університетом імені І.Горбачевського та Університетом медичним імені П’ястова Славського у Вроцлаві.

11-15 вересня 2017 року відбувся XV з’їзд Товариства мікробіологів України імені С.Виноградського (ТМУ) на базі Одеського національного університету імені І. Мечникова. У роботі з’їзду брали участь доцент кафедри мікробіології, вірусології та імунології О.Покришко з доповіддю «Antibiotic susceptibility of gramnegative microorganisms isolated from patients with urinary system diseases at the University Hospital of Ternopil in 2016» та асистент кафедри Н.Я. равець із стендовим повідомленням. Очолював роботу з’їзду президент Товариства мікробіологів України академік НАН України В.С. Підгорський. Від Тернопільського відділення ТМУ до організаційного комітету входив завідувач кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТДМУ, професор С.І. Климнюк. 

Доц.  О.В. Покришко взяла участь у восьмій європейська конференція Міжнародної спілки науковців з хвороби Лайма та асоційованих хвороб (ILADS)  на якій було розглянуто тему «Трансмісивні хвороби: інфекції, запалення, автоімунітет», яка відбулася у Варшаві 15-16 червня 2018 року. На конференції було вона представила постерну доповідь разом з  доц.  С.О. Никитюк на тему «Lyme disease, problem of diagnostics in children» («Лайм-бореліоз, проблеми діагностики в дітей»). Цей звіт про результат досліджень ряду науковців України, визнаний переможцем постерних доповідей конференції. 

 20-21 вересня 2018р. у Вінницькому національному медичному університеті  ім. М.І. Пирогова відбулася науково-практична конференція за міжнародної участі "Актуальні питання стратегії,тактики застосування і дослідження антибіотиків,антисептиків ,дезінфекторів" в  якій було представлено спільну роботу   науковців  Климнюк С.І., Романюк Л.Б., Волянська Л.А., Бурбела Е.І., Кравець Н.Я., Борак В.П " Бактеріологічне дослідження при гострих респіраторних інфекціях: актуально,інформативно та ефективно",яку представляла асит. Кравець Н.Я.

Участь доц. Покришко О.В. та асит. Кравець Н.Я. у 4-тому щорічному регіональному науковому симпозіумі в рамках концепції «Єдине здоров’я» за підтримки ПЗБЗ в Україні,що проходив у Києві з 20 по 24 травня 2019 р .

 5 листопада 2019 року відбулася наукова конференція:"Актуальні проблеми мікробіології, вірусології та імунології”, присвяченої 100-річчю з дня заснування кафедри мікробіології, вірусології та імунології  Національного медичного університету імені О. О. Богомольця  МОЗ України. У конференції також взяли участь представники профільних кафедр споріднених вузів та співробітники науково-дослідних інститутів.У роботі конференції взяли участь зі своїми виступами відомі представники наукової галузі член-кореспондент НАМН України, професор В.І. Задорожна, Заслужений лікар України, завідувач кафедри вірусології НМАПО професор І.В. Дзюблик, професор Г.К. Палій, завідувач відділу репродукції вірусів ІМВ НАН України С.Д. Загородня.  

Доцент Олена Покришко виступила з доповіддю «Physiology of Microorganisms, the Growth Curve Microbial Metabolism» в рамках the 6th Scientific Conference of Microbiology and Immunology Department (15-16th February 2020) в рамках візиту в Університет Мансури. 

Делегація викладачі ТНМУ у складі завідувача кафедри фармацевтичної хімії Лілії Логойди, доцента кафедри фармакології з клінічною фармакологією, керівника наукового відділу Оксани Шевчук, доцента кафедри управління та економіки фармації з технологією ліків Олени Покотило та доцента кафедри мікробіології, вірусології та імунології Покришко Олени  в 14-20 лютого 2020 року відвідала Університет Мансури (2020 рік)

20-21 лютого в м Києві відбувся конгрес з міжнародною участю з питань застосування пре- і пробіотичних засобів в медицині викладачі кафедри доценти Романюк Лідія,Олійник Ніна та асистент Кравець Наталія взяли участь у симпозіумі, де заслухали доповіді вчених України, Федеративної Республіки Німеччини, Фінляндії, Польщі, Хорватії.  . 

22-24 квітня 2021 року, в Тернопільському національному медичному університеті імені І.Горбачевського відбулася XXI Всеукраїнська науково-практична конференція з міжнародною участю «Довкілля і здоров’я», присвячена 35-ій річниці Чорнобильської катастрофи. 

Під час секційного засідання 24 квітня під головуванням завідувача кафедри мікробіології, вірусології та імунології, доктора медичних наук, професора Сергія Климнюка та кандидата медичних наук, доцента кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Наталії Ткачук. Було заслухано доповіді: доцента кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Олени Покришко «Досвід використання програми WHONET», доцента кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Наталії Ткачук «Аналіз сучасних методів раннього виявлення інфікованості населення М.TUBERCULOSIS», доцента кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Лідії Романюк «Гендерно-вікові особливості пацієнтів, хворих на вірусно-бактеріальну пневмонію, асоційовану з COVID-19», кандидат медичних наук Ірини Галабіцької «Вплив комплексного лікування пацієнтів з первинним остеоартрозом у поєднанні із захворюваннями, що супроводжуються зниженням екскретроної функції підшлункової залози, на дисбіоз товстої кишки», асистент кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Галини Михайлишин «Стан гуморального імунітету при бактеріальному вагінозі», аспірант кафедри мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ Віти Ясній «Застосування пробіотиків, як спосіб корекції мікробіоценозів у пацієнтів з цукровим діабетом». 

У Каїрі (Єгипет) 7-8 жовтня 2021 року відбулася сьома Євро-Середземноморська конференція LifeSciences, Pharma, and Biomedicine (BioNat-7). В умовах пандемії COVID-19 захід вирішено було провести у змішаній формі: перший день (7 жовтня 2021 р.) – зустріч у Каїрі, а 2 день (8 жовтня 2021 р.) – у вигляді вебінару (онлайн-зустріч). Доцент кафедри  Олена Покришко  секції  BioNat-7 представила доповідь на тему «Динаміка чутливості до антибіотиків мікроорганізмів, вилучених від пацієнтів, які перебувають на ШВЛ у відділенні інтенсивної терапії».

Доцент  О.В. Покришко  представила свою доповідь про зростання резистентності мікроорганізмів до антибіотиків  на BioNat-7 (2021 рік)

21 – 23 квітня 2022 року в Тернопільському національному медичному університеті імені І.Горбачевського відбулася ХХІІ Всеукраїнська науково-практична конференція з міжнародною участю «Довкілля і здоров’я». Захід організовано спільно кафедрою фізіології з основами біоетики та біобезпеки, кафедрою загальної гігієни та екології та кафедрою мікробіології, вірусології та імунології ТНМУ. 

Асистент кафедри Г.І. Михайлишин взяла участь у роботі Міжнародної науково-практичної конференції «Теоретико-практичні аспекти розвитку науки, освіти та суспільства»,яка відбулася в онлайн форматі 28 квітня 2023 р.,м. Рівне, Україна.