Кафедра мікробіології, вірусології та імунології, як самостійний структурний  підрозділ була заснована в липні 1957 року. З 1957-1997 рр. розташовувалась у приміщенні фізіологічного корпусу на Майдані Волі, 1, займаючи 5 кімнат. З вересня 1997- до сьогодні  у приміщенні ННІ медико-біологічних проблем на вул. Ю. Словацького, 2 . Протягом 1998-1999 років кафедра мікробіології була об’єднана з кафедрою медичної біології. Займає 5 навчальних аудиторій для практичних занять із студентами, має лабораторію мікробіологічних та паразитологічних досліджень (створена у 2005 році), які устатковані всім необхідним сучасним обладнанням, де виконуються навчальні, діагностичні, наукові дослідження. Першим завідувачем кафедри була доцент Галина Григорівна Василенко (з 1957 р. до 1963 р).